Die Zukunfts-Werkstatt e.V. hat seit ihrer Gründung im Jahre 1995 intensiv die Vernetzung lokaler und regionaler Organisationen vorangetrieben, die im weitesten Sinne in der Migrationsarbeit tätig sind. Im Ergebnis führte diese Arbeit zu einem Netzwerk potentieller Kooperationspartner/innen für eine Zusammenarbeit in verschiedenen Tätigkeitsfeldern (Gesellschaft, Politik, Kultur). Ferner gehört die Zukunfts-Werkstatt zu den Gründungsmitgliedern der AMFN („Arbeitsgemeinschaft Migrantinnen und Flüchtlinge in Niedersachsen“) und der „Bildungsgenossenschaft Südniedersachsen e.G.“ (BIGS).

Im Bereich der Qualifizierungsmaßnahmen kooperierte die Zukunfts-Werkstatt in der Vergangenheit mit dem Arbeitsamt Göttingen, dem Amt für Beschäftigungsförderung der Stadt Göttingen, den Sozialämtern der Stadt und des Landkreis Göttingen.